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李德泉 ( Dequan Li )


出生年月: 19764
E-mail:
dqli@jdl.ac.cn or dequanli@gmail.com

电话:010-6260 0567

目前在中科院计算技术研究所攻读博士学位。

研究兴趣:

计算机应用 生物信息学(Bioinformatics) 数据管理 统计模式识别

简历下载: 中文 英文


十年磨一剑,亮剑毕一功。本人十分愿意结交各界朋友,彼此共勉,如有机会共事,幸甚幸甚。


最大特点:经验全面!

既能扎根项目解决问题赤膊写code

又能立足研究学术深入英文写paper

既曾为一螺钉大家合作建系统,

又曾组建团队研发产品推成果;

既有研究所里埋头苦干解疑惑,

又有学校讲台激情飞扬传经验;

既曾设计系统软件开发,

又曾担当网管硬件维护;

求学丰富学识不忘提高动手能力,

授课学术交流不忘提升管理技能。

曾获荣誉:

  1994-1998 年,获入学特别奖学金,每年度分别获院三好学生、院优秀学生干部、院优秀共产党员。

  1998年7月 获 “辽宁省优秀大学毕业生”称号。

  2006年1月 获 中科院计算所“所长奖学金”优秀奖

  2006年7月 获 中国科学院研究生院“三好学生”




2003/3
~ 中国科学院计算技术研究所 计算机应用专业 博士
专业方向:机器学习及模式识别,生物信息学。
师从国内著名计算机领域专家 高文 教授。

1999/9-2002/7
辽宁师范大学 计算机与信息技术学院 计算机应用专业 硕士
答辩论文:基于WEB的边防检查办公自动化系统的实现。
师从计算机学院院长 刘小丹 教授

1994/9-1998/7
沈阳工业学院 计算机系 计算机软件专业 工学学士
毕业论文:利用OpenGL实现某型导弹演示模拟系统。成绩:优

学生会学习部部长 辽宁省优秀大学毕业生


Publications - 期刊:

  • Dequan Li, Wen Gao, Charles X. Ling, Xiaobiao Wang Ruixiang Sun, and Simin He. IndexToolkit: An Open Source Toolbox to Index Protein Databases for High-throughput Proteomics.Bioinformatics, 22(20), pp2572-2573, 2006.
  • Dequan Li , Yan Fu , Ruixiang Sun, Charles X. Ling, Yonggang Wei, Hu Zhou, Rong Zeng, Qiang Yang, Simin He and Wen Gao. pFind: a novel database-searching software system for automated peptide and protein identification via tandem mass spectrometry. Bioinformatics , 21(13), pp3049-3050, 2005.
  • Yan Fu , Qiang Yang, Ruixiang Sun, Dequan Li , Rong Zeng, Charles X. Ling, Wen Gao. Exploiting the kernel trick to correlate fragment ions for peptide identification via tandem mass spectrometry. Bioinformatics . Vol.20, pp1948-1954, 2004.
  • 陈益强, 高文, 付岩, 李德泉, 陈翔. 基于信息技术的蛋白质识别研究 . 生命科学, Vol.15,No.2,pp70-78, 200304
  • 李德泉 ,付岩,孙瑞祥,贺思敏,高文. 肽鉴定结果评估模型的特征选择研究. 计算机研究与发展,Vol. 42,增刊B, pp178-183, 200509 (Chinese )
  • 孙瑞祥,付岩, 李德泉 ,张京芬,王晓彪,盛泉虎,曾嵘,陈益强,贺思敏,高文. 基于质谱技术的计算蛋白质组学研究, 中国科学E:信息科学, 36(2):222-224,2006.

国际国内会议:

  • Dequan Li , Yan Fu, Ruixiang Sun, Simin He, and Wen Gao.Feature Selection for Significance Evaluation of Peptide Identification. In Proceedings of CSCA 2005, Beijing, China, Sep.23-25, 2005
  • Dequan Li , Ruixiang Sun, Yonggang Wei, Hu Zhou, Rong Zeng, Simin He, Wen Gao. pFind: A Novel Web-based Application for Automated Identification of Peptide and Protein by MS/MS Data . In Proceedings of HUPO 3rd Annual World Congress, Beijing, China, Oct.25-27,2004
  • Yan Fu, Qiang Yang, Charles X. Ling, Haipeng Wang, Dequan Li , Ruixiang Sun, Hu Zhou, Rong Zeng, Yiqiang Chen, Simin He, Wen Gao. A Kernel-based Case Retrieval Algorithm with Application to Bioinformatics. In Proceedings of the 8th Pacific Rim International Conference on Artificial Intelligence (PRICAI 2004), Auckland, New Zealand, August 9-13, 2004, LNAI 3157, pp. 544553.

负责开发的软件

  • The main developer of pFind , our database-searching software tool.
  • IndexToolkit , an open source toolbox to index protein databases for high-throughtput proteomics.

博士期间研究相关项目

  • 国家973项目“基于信息技术的蛋白质组研究”

  • 国家重大专项“人类肝脏蛋白质组研究”(HLPP)
  • 网络鉴定平台(http://pfind.jdl.ac.cn)总体设计及具体开发
  • 串连质谱鉴定蛋白质软件pFind 1.0到目前版本版本的架构设计、管理与开发
  • 网络开源项目IndexToolkit的设计与开发。

教育与培训经验

北京市朝阳社区学院,教授《 Delphi 程序设计》。(2005

北京市朝阳社区学院,教授《信息系统案例分析及课程设计》(2006

北京市怀柔广播电视大学,教授《信息系统案例分析及课程设计》(2006

之前及其他项目

某边防检查站业务管理系统及办公自动化系统. (Lotus Notes, 2002),并担任某边防检查站系统管理员.

《图释分析化学CAI》教学光盘. (2001)

沈阳红梅味精厂、丹东市工商局等单位的信息管理系统. (1997)

构建某型号的演示模拟系统的最初框架代码. (1997)

商务博客项目,作为主要负责人,负责组建研发团队和进行项目开发。(2005,J2EE)